RM 8392是由美國國家標(biāo)準(zhǔn)與技術(shù)研究院(NIST)開發(fā)的一種人類DNA標(biāo)準(zhǔn)參考物質(zhì),主要用于全基因組變異評估。這種參考材料來自一個家族三口之家,他們的祖先有東歐德系猶太血統(tǒng)。這個家族包括父親(RM 8391)和他的兩個兒子(RM 8392和RM 8393)。RM 8392特別重要,因為它代表了家族中的一個個體,并且可以用來進行基因組變異的評估和研究。
一個RM8392 人DNA全基因組變異標(biāo)準(zhǔn)品單元由三個小瓶組成,其中包含來自特定家族成員的人類基因組 DNA;從科里爾醫(yī)學(xué)研究所(卡姆登,新澤西州)的三個大型人類淋巴母細胞系中提?。篏M24385(兒子)標(biāo)記為 HG-002,GM24149(父親)標(biāo)記為 HG-003,GM24143(母親)標(biāo)記為HG-004。每個小瓶含有大約 10 μg 基因組 DNA,DNA 位于 TE 緩沖液(10 mM TRIS,1 mM EDTA,pH 8.0)中。
NIST RM 8392 人類DNA 全基因組變異評估旨在通過獲得真陽性、假陽性和假陰性的估計值來評估人類基因組測序變異檢出的性能。測序應(yīng)用可能包括全基因組測序、全外顯子組測序和更有針對性的測序,例如基因組。這種基因組 DNA 的分析方式與實驗室處理和分析提取的 DNA 的任何其他樣本相同。由于 RM 是提取的 DNA,因此它對于評估 DNA 提取等分析前步驟沒有用處,但它確實挑戰(zhàn)了測序文庫的制備、測序機器以及作圖、比對和變異調(diào)用的生物信息學(xué)步驟。此 RM 并非旨在評估后續(xù)的生物信息學(xué)步驟,例如功能或臨床解釋。
RM8392 人DNA全基因組變異標(biāo)準(zhǔn)品在基因組學(xué)研究中扮演著關(guān)鍵角色,因為它提供了一種可靠的基準(zhǔn),以供科學(xué)家們比較和校準(zhǔn)他們的基因組變異數(shù)據(jù)。這有助于提高基因組數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和可靠性,進而促進對遺傳疾病的理解和治療的研究。
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